Es kommt zu folgenden Änderungen im Nahverkehr: Alle Interregio-Express-Züge (IRE) fallen zwischen Basel Badischer Bahnhof und Albbruck/Waldshut aus, fahren aber im jeweils verbleibenden Abschnitt östlich der Baustelle nach Regelfahrplan. Auch die Regionalbahnen (RB) verkehren zwischen Laufenburg/Waldshut und Lauchringen tagsüber zu den üblichen Zeiten.
Zwischen Basel und Rheinfelden pendeln nur Regionalbahnen etwa im 30-Minuten-Takt mit Halt an allen Unterwegsstationen. Außer in Tagesrandlagen erfolgt die Abfahrt in Basel stündlich zu den Minuten 17 und 47, in Rheinfelden zu den Minuten 25 und 52. Am Morgen und abends gilt ein abweichender Ersatzfahrplan. Die Bahn empfiehlt Reisenden, möglichst eine frühere Verbindung zu wählen.